各系差異
Q:如何選系
A:大學校系千百種，難免會有系名相近、領域重疊的系。就算有部分領域重疊，學的東西著重點也不一樣。本系的目的便是培育「建構永續環境的工程師」：從水土資源保育切入，了解生物與環境的關係後，探究如何用工程手段建構對生物友善的永續環境。 以下是由系上的學長姐，為即將入學的各高中生彙整的相關資訊。
Q:生工系與環工系的差異
A:環工領域泛指「調整被人類生活改變的環境物理因子」的這動作，所以空汙、水汙、土壤汙染、固體廢棄物（垃圾）汙染、噪音汙染的防治與測定等領域，甚至自來水淨化都是環工的範圍。簡言之，環工以解決環境污染為主要任務。 生工著重在生態環境與水土資源的規劃與管理面向，與環工重疊的部分主要在於水質淨化、污染物擴散分析（汙染物在流體中的移動）及環境毒理等與水、流體相關的部分，其他領域較少涉及。若想修更多環工領域的課程，每學期系上有一部份同學會選擇至台大環工所修課（台大並無環工系）。 近年來已有部分環工系所開始研究規劃管理（e.g. 台大環工所有規劃管理組），但實質研究面向會因各校而異。
Q:生工系與土木系的差異
A:如果有細看過土木系跟生工系的課程安排或許會疑問，兩邊都有跟工程相關的科目（e.g. 工程數學、土壤力學…），但為何土木系有許多很深入的科目（特別是力學），生工少很多，反而有其他類別的課程（e.g. 生態）？最主要的原因是兩邊關注的點不同。 土木較在意的是「工程」本身，包含大地、運輸、建築等實際工程設施，著重力學、結構等的設計建造，另外還有許多領域，有興趣的人可以詳細研究台大土木系大學部的 6 個學群。 至於生工，我們學的工程多跟「水」相關，部分老師在研究坡地災害、綠建築等其他領域的工程。但我們著重在「評估工程對環境的影響」，而非真的蓋出實際的設施。因此我們雖然不用像土木系把工程修的這麼深入，但還是需要一定的知識。 比如建在熱帶國家的玻璃帷幕建築或某阻隔水流的水工構造物（橋、壩等），可能兼備機能、美學、結構，但若缺乏對整個環境的系統性思考，對環境可能會造成傷害，評估這種工程對環境的影響便是生工系與土木系的不同。
Q:生工系與土木系水利組/水利系的差異
A:在水利工程、水文分析、水資源規劃等領域重疊。而差異的部分，生工系有更多跟生態、環境、氣候變遷、農業、永續規劃的應用；台大土木系大學部的分群（挑一群修完規定的課）中沒有水利學群，在研究所水利組專精在水利工程、水文分析、水資源規劃等研究上，較少涉及到生態；其他學校水利系（e.g. 成大水利系）還包含海洋工程等其他領域，水利工程組有部分學校會導入生態，但更專注於水利工程本身，生工系應用在生態環境的層面相對較廣。
Q:生工系與水土保持學系的差異
A:本系以「水」為主軸，與「土」相關之必修課有土壤力學與水土保持工程。土壤力學是過去設計渠道、建置壩體所需之學科；而水土保持工程是考慮防洪防災或水庫淤沙所需。與水保之關係，是因自然界土壤流失之第一大因素為「水」，故系上領域有水土保持工程之研究，但必修課僅有此兩門，若是有興趣，可在選修、專題與研究所時接觸。 水土保持為本系以「水」發展出的領域之一，並非學生必須走的主軸方向；而水保系綜合森林、土木、大地工程及環境保育，專精於水土保持這門學科中。在沒有水保系的台大，森林系也有討論植披與土壤沖蝕相關性的課程，以保育森林內的水土資源為主，如水土保持學。而生工系更注重在坡地防災等問題的解決，除了坡地以外也包含平地的防洪防侵蝕等等，因此所開課程為水土保持「工程」。
Q:生工系與地理/大氣/地質系的差異
A:生工是工程類科系，而工程就是「解決問題」。當我們碰到各式各樣的環境問題時，我們會開始想要評估、確立問題的嚴重性，以便做進一步的工程規劃。地理系、大氣系及地質系則是屬於理學院，偏重理論研究。例如對氣候變遷有興趣，若比較喜歡研究氣候變遷的成因、證明它的存在、預估氣候，大氣系會是個好選擇；如果你想知道要如何評估氣候變遷帶來的衝擊，那就歡迎來生工系。
Q:生工系與生命科學系的差異
A:生工是「工程」，目標是結合工程與生態的概念，因此我們關心的是整體生態系統是否受到影響，在開發同時也能維持永續經營。而生科是「科學」，目標是了解各種生物體的特性與各種生物之間的差異。
Q:生工系與生物工程學系的差異
A:除了系名類似外，學的東西完全不同喔！有些大學的生物工程學系也會簡稱生工，但台大生工是「生物環境的」系統工程，主要研究工程對環境的影響，營造永續環境；生物工程則是將數、物、化等學科結合生物學，應用於醫學、食品等等。