回顧過去50年，臺灣由農業社會積極轉型發展工業，但超限開發卻造成生態環境日益惡化， 導致人類面臨比以往更嚴峻的水土災害威脅。本系乃應用高科技工程技術以改善或保護生產、生活及生態環境之專門學科，因此，過去教學研究涵蓋「生物環境工程」、「生態工程與水土資源」及「 生物環境系統與資訊」等三大領域。之後為符合教學研究發展需求， 將領域進行重整成為兩大面向： 「生態環境規劃」與「水土資源工程」。本系現有學生約三百餘人，專任師資24位，教學研究設備相當完備，課程設計輔以測量、環境化學、土壤沖蝕力學與流體力學等試驗課程。畢業學生頒授予工學學士、工學碩士或工學博士等學位。